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Einige reinrassige Hunde sind genetisch veranlagt, irgendwann in ihrem Leben bestimmte Krankheiten zu entwickeln. Zusammen mit diesen Merkmalen teilen sie auch die Gene für angeborene oder erbliche Krankheiten und Störungen.
Allergien
Zwergpudel sind für verschiedene Krankheiten prädisponiert und teilen einige dieser Krankheiten mit ihren größeren Cousins, dem Standardpudel. Einige von ihnen sind relativ gering, wie z. B. Allergien gegen bestimmte Lebensmittel; und Atopie oder Inhalationsallergie. Eine Komplikation der Atopie, atopische Dermatitis, ist eine Hauterkrankung, die durch eine Reaktion auf eine Inhalationsallergie verursacht wird.
Störung des Bewegungsapparates
Patellaluxation, ein Zustand, bei dem die Kniescheiben ein- und ausrutschen; und epiphysäre Dysplasie, die die Entwicklung der langen Knochen beeinflusst, kann bei Zwergpudeln angeboren sein. Ebenfalls bei der Geburt vorhanden ist die Veranlagung zur Osteogenesis imperfecta, die das normale Wachstum und die Funktion der Knochen beeinflusst; und Osteochondrose, die den Gelenkknorpel betrifft. Die Bandscheibenerkrankung ist dadurch gekennzeichnet, dass die Bandscheiben nicht richtig sitzen und reißen können. Die Legg-Calve-Perthe-Krankheit und die Hüftdysplasie sind zwei Erkrankungen, die die Hüfte betreffen. Bei letzterem passen Hüftkugel und Hüftpfanne nicht gut zusammen, und bei ersteren führt eine unzureichende Blutversorgung des Femurs zum Verlust des Hüftknorpels.
Autoimmunerkrankungen
Bei Zwergpudeln wie Auto-von-Willebrand-Krankheit und Hämophilie A treten mehrere Autoimmunerkrankungen auf, beides Blutungsstörungen; Epilepsie und andere neurologische Erkrankungen und Erkrankungen des Gehirns; Morbus Cushing oder überaktive Nebennieren; und Hypothyreose, überaktive Schilddrüsen. Myasthenia gravis ist eine Abnormalität der Muskeln und Nerven.
Tumoren
Zwergpudel sind sowohl anfällig für krebsartige als auch für nicht krebsartige Tumoren, die die Haut betreffen, wie Basalzell- und Talgdrüsentumoren sowie Plattenepithelkarzinome.
Augen und Ohren
Bei einigen Zwergpudeln tritt Taubheit aus verschiedenen Gründen auf, ebenso wie Nachtblindheit. Epiphora oder Überproduktion von Tränen ist am deutlichsten bei weißen Pudeln zu beobachten, die manchmal rote oder braune Tränenflecken aufweisen. Katarakte, Glaukom, Irisatrophie (abnehmende Iris) und Tränenwegatresie (schlecht geformte oder fehlende Tränenwege) sind alle Erkrankungen des Auges. Eine fortschreitende Netzhautatrophie, eine fortschreitende Verschlechterung der Netzhaut, kann zur Erblindung führen. Ohrenentzündungen sind bei Pudeln aller Größen häufig.
